Antes de la llegada de los españoles la peninsula de Baja California estuvo habitada por grupos indígenas nómadas como los pericúes en la región sur, los guaycuras en el centro, los cochimíes en la parte norte y algunos otros clanes hasta hoy desconocidos. Lo anterior queda de manifiesto con las pinturas rupestres que se han descubierto en las zonas montañosas de todo el territorio.
En 1534 tuvo lugar el primer encuentro de los peninsulares con elespañol Fortún Jiménez de Bertadoña, quien desembarcó en esteterritorio y junto con su tripulación se dedicó a buscar perlas.
En 1535, el descubridor Hernán Cortés desembarcó en esta tierra,dándole el nombre de Bahía de la Santa Cruz, en honor a la fecha de sullegada. Fundó una colonia que no prosperó y debido a las constanteshostilidades con los indígenas, partió para exiliarse en el Puerto deAcapulco.
En 1596, por acuerdo del Rey de España, Sebastián Vizcaíno fuecomisionado para explorar la Baja California, desembarcando en la bahíade Santa Cruz la que rebautizó con el nombre de La Paz. Sin embargo, laverdadera conquista espiritual en este territorio tendría lugar hasta1697 con la llegada del jesuita Juan María Salvatierra, quien fundó laprimera misión dedicada a Nuestra Señora de Loreto.
En el transcurso de los 70 años que permanecieron en la peninsula, 59padres establecieron 18 misiones, efectuando una extraordinaria laborque sentó las bases del desarrollo de este territorio.
Hasta 1804 las Californias son divididas y se establece un gobiernoindependiente en cada una de ellas: La Alta en el Puerto de Monterrey yel sur en el pueblo de Loreto.
En 1830 la ciudad de La Paz fue designada como capital, en sustituciónde Loreto que habia sido destruida por fuertes temporales. Sería hastael año de 1888 cuando el presidente Porfirio Díaz ordena la división deBaja California en dos.
En 1974 la Cámara de Senadores emitió el dictamen para aprobar eldecreto presidencial por el cual el territorio de Baja California Surpasó a ser estado libre y soberano.